自己的阿姨吸毒，会不会影响自己的三代政审？

有影响。审环节审查的是考生本人是否有刑事犯罪记录，以及直系亲属或者对自身成长有重大影响的旁系血亲是否有较严重的刑事犯罪记录。有吸毒案底会影响子女公务员政审。依据《公务员法》第二十四条下列人员不得录用为公务员：
(一)曾因犯罪受过刑事处罚的；
(二)曾被开除公职的；
(三)有法律规定不得录用为公务员的其他情形的。无犯罪记录不符合公务员法的规定，也就是无犯罪记录不包括《治安管理处罚法》规定的处罚。