养殖小区内建房是违建吗？镇府可以拆除吗？

违章建筑不管多少年都是违章的，通知当地的相关部门是可以进行的。
违章建筑，从严格意义上讲，是指违反《土地管理法》、《城乡规划法》、《村庄和集镇规划建设管理条例》等相关法律法规的规定动工建造的房屋及设施。
拆除违法建筑的一般执法程序是：
1、执法部门下达书面的整改通知书或限期拆除通知书或行政处罚文书，在文书上会告知你违法的事实、处罚的依据、限期拆除或整改的时间、对处罚不服的诉讼或复议申请时间和部门等内容，而且文书上要有执法单位的公章，执法人员在送达文书时必须是两人以上，而且必须将文书送达给你或你的直系亲属（你是否签收不是必须的，只要送达就可以），如果你的违法建筑未处于使用状态，个别城市也允许现场张贴送达（这种送达方式的合法性本身就存在争议）；
2、的部门，既可以是执法部门，也可以是，但如果涉及到罚款的话，则必须由执行。从你陈述的情况看，你们当地的执法部门并未履行上述程序，则他们的执法涉嫌程序违法，你可以到当地市政府行政复议机关（一般是市政府或区政府法制办，看执法单位的行政级别和隶属）或直接到人民提起行政诉讼。具体依据的法规是《行政处罚法》和《城乡规划》，《行政处罚法》第三十一条在作出行政处罚决定之前，应当告知当事人作出行政处罚决定的事实、理由及依据，并告知当事人依法享有的权利。第三十四条执法人员当场作出行政处罚决定的，应当向当事人出示执法身份证件，填写预定格式、编有号码的行政处罚决定书。行政处罚决定书应当当场交付当事人。前款规定的行政处罚决定书应当载明当事人的违法行为、行政处罚依据、罚款数额、时间、地点以及名称，并由执法人员签名或者盖章。执法人员当场作出的行政处罚决定，必须报所属备案。第三十五条当事人对当场作出的行政处罚决定不服的，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。《规划法》
第六十四条未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。第六十五条在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。第六十六条建设单位或者个人有下列行为之一的，由所在地城市、县人民政府城乡规划主管部门责令限期拆除，可以并处临时建设工程造价一倍以下的罚款：
（一）未经批准进行临时建设的；
（二）未按照批准内容进行临时建设的；
（三）临时建筑物、构筑物超过批准期限不拆除的。第六十八条城乡规划主管部门作出责令停止建设或者限期拆除的决定后，当事人不停止建设或者逾期不拆除的，建设工程所在地县级以上地方人民政府可以责成有关部门采取查封施工现场、等措施。