有了市级法院终审判决书没有协助执行通知书办理房产更名可以吗？

需要申请执行才可以。判决并不能当然执行。有关单位在有协助执行通知书的情况下，才有法定的义务配合办理。《民事诉讼法》第二百四十二条被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民有权向有关单位查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产情况。人民有权根据不同情形扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。人民查询、扣押、冻结、划拨、变价的财产不得超出被执行人应当履行义务的范围。人民决定扣押、冻结、划拨、变价财产，应当作出裁定，并发出协助执行通知书，有关单位必须办理。