表舅妈的公司前几天因为一员工想要申请工伤认定，具体是员工因为有先天性疾病，上次住院治疗花费了不少的费用，想进行报销，表舅妈不知道算不算，工作中先天性疾病算不算工伤？

不算工伤。上班时间，分为正常上班时间和时间。员工是在正常上班时间发病亦或是在加班时间发病，所能享受的待遇并不尽相同。工伤，是指劳动者在从事职业活动或者与工作有关的活动时，所遭受的外在不良因素的伤害和伤害。
我国《工伤保险条例》第十四条规定：“职工有下列情形之一的，应当认定为工伤：
(一)在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的;
(二)工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的;
(三)在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的;
(四)患职业病的;
(五)因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的;
(六)在上下班途中，受到机动车事故伤害的;
(七)法律、行政法规规定应当认定为工伤的其他情形。”
第十五条规定“职工有下列情形之一的，视同工伤：
(一)在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的;
(二)在抢险救灾等维护国家利益、公共利益活动中受到伤害的;
(三)职工原在军队服役，因战、因公负伤致残，已取得革伤残军人证，到用人单位后旧伤复发的。”
通常情况下，我们看员工受伤或发病是否属于工伤，应看其是否是在工作时间、工作场所，因工作原因而受到伤害，即工伤的认定应符合《工伤保险条例》第十四条关于认定工伤的三个要件。