公安部门查到我有案底，但是公安部门又查出我有案底，

如果当事人确实没有违反犯罪的前科，那么铁路警察的说法属于违规的。当事人可以要求其查实相关情况，或者直接向上一级公安机关，检察院，督查等部门进行举报。根据《人民警察法》第九十四条(上级监督)上级公安机关应当对下级机关的执法活动进行监督，发现其作出的处理措施或者决定有错误的，有权撤销、变更或者责令下级机关撤销、变更;发现其不履行法定职责的，有权责令其在一定期限内履行。第九十五条(外部监督)人民警察执行职务，依法接受行政和人民检察院的监督。对人民警察的违法行为，任何公民、法人和其他组织有权依法向行政或者人民检察院检举、控告。受理检举、控告的机关应当及时查处，并将查处结果告知检举人、控告人。对依法检举、控告的公民、法人和其他组织，任何机关和个人不得压制和。第九十六条(督察制度和投诉委员会)公安机关建立督察制度，对公安机关及其人民警察履行职责、行使权力和遵守纪律情况实施监督。