拆迁协议由哪个部门保管

1、房屋征收拆迁补偿方案是由房屋征收部门拟定的，由市、县级人民政府组织有关部门进行论证。
2、法律依据
《国有土地上房屋征收与补偿条例》
第十条　房屋征收部门拟定征收补偿方案，报市、县级人民政府。
市、县级人民政府应当组织有关部门对征收补偿方案进行论证并予以公布，征求公众意见。征求意见期限不得少于３０日。