我们公司和一家公司签订了商品买卖合同。已经两年了，对方到现在都没有支付货款。根据商品买卖合同法，还可以提起诉讼吗？

根据商品买卖合同法的法律规定，买卖合同的诉讼时效从债务人履行期限届满开始计算，一般为两年。因为你们的货款是分期支付的，所以应当按照的履行期限届满之日起计算三年。
如果你们公司在这期间一直没有向对方公司催收过质保金，除非对方自愿履行，否则这部分债权已经过了3年的诉讼时效，即使诉讼，也不能得到法律的保护。
如果这两件期间你们曾有过催收的事实出现（比如催款单、电话催收记录），诉讼时效可以从这个时间开始重新计算3年。
开发票只能证明你们之间有债权债务关系，证明买卖事实的存在，对主张债权没有影响。