离婚时协议补偿款到底该如何执行

（一）双方能协商时，自行履行补偿款支付，达成一致后完成支付操作。
（二）一方不履行协议，另一方向法院起诉，要求按协议支付补偿款，等待法院判决并获取判决书。
（三）获得胜诉判决后对方仍不履行，胜诉方在规定履行期届满后两年内，向一审法院或与一审法院同级的被执行财产所在地法院申请强制执行。法院会采取查询、冻结、划拨存款，查封、扣押、拍卖、变卖财产等措施。情节严重时，被执行人会被列入失信名单、限制高消费。

法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十九条规定，被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权向有关单位查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产情况。人民法院有权根据不同情形扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。人民法院查询、扣押、冻结、划拨、变价的财产不得超出被执行人应当履行义务的范围。