我叔叔在外资企业工作，因为看到企业遇到大麻烦了，就自己出资给入股了，资本金已经投入成功了，甚至还向股东借款来周转了，那么资本金结汇还股东借款吗？

应该可以，如果你要企业以资本金结汇所得人民币资金偿还人民币贷款，须提交该笔贷款资金已按合同约定在批准的经营范围内使用的说明。
下面是资本金结汇的概念。
资本金结汇是必须专款专用，具体见汇综发[2008]142号《关于完善外商投资企业外汇资本金支付结汇管理有关业务操作问题的通知》。
　　如结汇需要提供以下资料：
　　
（一）外商投资企业外汇登记IC卡。
　　
（二）资本金结汇所得人民币资金的支付命令函。
　　支付命令函是指由企业或个人签发，银行据以将结汇所得人民币资金进行对外支付的书面指令。
　　
（三）资本金结汇后的人民币资金用途证明文件。
　　包括商业合同或收款人出具的支付通知，支付通知应含商业合同主要条款内容、金额、收款人名称及银行账户号码、资金用途等。企业以资本金结汇所得人民币资金偿还人民币贷款，须提交该笔贷款资金已按合同约定在批准的经营范围内使用的说明。
　　
（四）会计师事务所出具的最近一期验资报告（须附外方出资情况询证函的回函）。
　　
（五）前一笔资本金结汇所得人民币资金按照支付命令函对外支付的相关凭证及其使用情况明细清单（格式见附件2）和加盖企业公章或财务印章的发票等有关凭证的复印件。若该笔结汇为一次性或分次结汇中的最后一笔，企业应当于结汇后的5个工作日内向银行提交前述材料。
　　
（六）银行认为需要补充的其他材料。
　　等值5万美元（含）以下企业备用金结汇的，企业无需提交第
（三）、
（五）项文件，其资本金账户利息可凭银行出具的利息清单直接办理结汇。
　　资本金结汇原则：一是资金已验资，二是实用实结，不允许提前结汇