民间借贷纠纷已还清余款该怎么结案

针对民间借贷中出现的债务人拖欠债务不予归还的情况，如经过债权人反复敦促仍旧无法实现还款目的时，债权人有权依据相关法律法规向当地的人民法院提起诉讼，主张自身的合法权益。
在此过程中，债权人需要特别关注诉讼时效问题。
根据我国现行法律规定，公民、法人或其他组织向人民法院申请保护其民事权益的诉讼时效期限为三年。
但若法律另有特殊规定的，则应按照该特殊规定执行。
诉讼时效的起算时间通常从权利人知晓或应当知晓其权利遭受侵害及义务人之日开始计算。
《民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。
法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
法律另有规定的，依照其规定。
但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。