汽车违章扣分是扣在车上还是车主上，就是说被电子眼抓拍后是根据车牌号处理还是根据该车驾驶员处理

电子眼抓拍根据车牌登记信息，扣分罚款应是车牌登记人的，和当时谁驾驶无关的，如果是路查违章，应处罚当时驾驶车辆者，和车的主人没有关系的。
《道路交通安全法》第二十四条
公安机关交通管理部门对机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的行为，除依法给予行政处罚外，实行累积记分制度。公安机关交通管理部门对累积记分达到规定分值的机动车驾驶人，扣留机动车驾驶证，对其进行道路交通安全法律、法规教育，重新考试；考试合格的，发还其机动车驾驶证。 对遵守道路交通安全法律、法规，在一年内无累积记分的机动车驾驶人，可以延长机动车驾驶证的审验期。具体办法由公安部门规定。