在货物发生毁损、灭失的情况下，承运人的损失赔偿额应当依据以下四个原则计算：
一、当事人对货物毁损、灭失的赔偿额有约定的，就应当按约定数额进行赔偿。当事人在合同中可能规定了一个总的赔偿数额，也可能规定了一个赔偿额的计算方法。但有的情况下，当事人办理了保价运输。所谓保价运输就是承运人处理托运人。收货人提出赔偿要求的一种方式，即托运人在办理托运货物的手续时或者与承运人签订合同时，向承运人要求进行保价运输，声明货物的价格，并支付保价费。这实际上是当事人之间对货物损害赔偿额的一种约定。一般情况下，保价额相当于货物的价值。托运人办理保价运输的，承运人应当按照实际损失进行赔偿，但最高不得超过保价额。实际损失低于保价额的，按照实际损失进行赔偿。
二、当事人对赔偿额没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同有关条款或者交易习惯确定。
三、如果依照前一原则仍不能确定的，则按照交付或者应当交付时货物到达地的市场价格计算。这里的“交付时”是指货物按时到达了目的地，货物有毁损的情况下，计算市场价格的起算时间；“应当交付时”是指货物没有按时到达，而货物毁损、灭失的情况下，市场价格的起算时间。
四、法律、行政法规对赔偿额的计算方法和赔偿限额另有规定的，应当依照其规定进行赔偿。例如民用航空法规定，国内航空运输承运人的赔偿责任限额由民用航空主管部门制定，报批准后公布执行。对托运行李或者货物的赔偿责任限额，每公斤为17计算单位。对于法律、行政法规的这些规定，应当在计算承运人的赔偿额时予以遵守。 需要注意的是，如果托运人在托运货物时自愿办理了货物运输保险的，在发生货物的毁损、灭失等保险事故时，应根据保险合同向保险人索赔。但保险人给付保险赔偿金后取得对承运人的赔偿金的代位求偿权。
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