子女变更抚养权后学籍怎么办

不一定，抚养权与户口没有必然的关系，可以双方协商决定！根据《婚姻法》相关规定：
1、离婚后，子女随谁（含户口），由夫妻双方协商。协商不成，任何一方可以向，由判决。哺乳期内的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。
2、离婚当事人可持原户口簿和的判决书或调解书到当地公安派出所办理分户或迁转手续，当地公安派出所应依据的判决或调解书，按照分户、立户的规定予以办理。
3、如一方当事人不愿交出原户口簿，经公安派出所动员说服无效的，可按判决或调解书办理分户或迁转手续，并在户口登记簿上注明分户日期和原因