调解合同纠纷的方式有:
1、依法向人民法院起诉,由人民法院调解;
2、根据仲裁协议申请仲裁机构仲裁,由仲裁机构先行调解;
3、当事人也可以请信任的第三方来组织调解。
4、根据《中华人民共和国仲裁法》第五十一条
仲裁庭在作出裁决前,可以先行调解。当事人自愿调解的,仲裁庭应当调解。调解不成的,应当及时作出裁决。 调解达成协议的,仲裁庭应当制作调解书或者根据协议的结果制作裁决书。调解书与裁决书具有同等法律效力。
第五十二条
调解书应当写明仲裁请求和当事人协议的结果。调解书由仲裁员签名,加盖仲裁委员会印章,送达双方当事人。