当重伤案件达成私了协议后,通常司法机关会尊重当事人的意愿。这是因为私了体现了当事人对自身权益的处置权。但要是私了协议出现违反法律强制性规定的情况,比如协议内容违背了刑法中关于重伤罪的相关条款,或者损害了国家、集体以及他人的合法权益,那司法机关就不会坐视不管,而是会依法进行追诉。
按照《刑法》的要求,故意伤害导致他人重伤,要处三年以上十年以下有期徒刑。即便双方已经私下达成和解,可如果司法机关经过审查,觉得有追诉的必要,比如犯罪情节较为严重、对社会秩序造成较大影响等,依然会依法对犯罪嫌疑人进行判刑,以维护法律的尊严和社会的公平正义。
不过,如果伤害行为的情节非常轻微,对他人和社会都没有太大危害,不被认定为犯罪,又或者犯罪已经过了追诉时效期限,那么这种情况下,就可能不会再追究刑事责任了。总之,到底是否追究刑事责任,需要综合考虑案件的实际细节以及相关的法律规定,这样才能做出最恰当的判断。