检察院对运输毒品罪会怎么处理

（一）检察院受理运输毒品案件后仔细审查证据和犯罪事实，确保准确判断案件情况。
（二）当认定犯罪事实清楚、证据确凿且应追究刑责时，及时提起公诉，保障司法程序推进。
（三）遇到事实不清、证据不足的情况，合理运用退回补充侦查或自行侦查的权力，补充侦查不超两次且每次一个月，使证据更加完备。
（四）对于犯罪情节轻微或不符合起诉条件的，依法作出不起诉决定，体现司法公平与严谨。

法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条规定，人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。