检察院批捕三月羁押期满后怎么办

（一）侦查终结后，公安机关应及时将案件移送检察院审查起诉，保证司法流程顺利推进。
（二）检察院审查时需准确判断证据情况，若犯罪事实清楚、证据确实充分应及时公诉；若证据不足则依法退回补充侦查，且监督公安机关在规定期限内完成补充侦查工作。
（三）对于侦查期限问题，若案件复杂需延长，应严格按照规定向上级检察院申请，确保程序合法。
（四）一旦发现不应追究刑事责任，要立即释放并发放释放证明，保障当事人合法权益。

法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条规定，人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料；认为可能存在本法第五十六条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。

1.检察院批捕后羁押三月期满，若侦查终结，公安机关会将案件送检察院审查。若犯罪事实清楚、证据充分，检察院会公诉；证据不足则退回补充侦查，限两次，每次一个月。
2.案件复杂期满未侦查完，经上一级检察院批准可延一个月；重大复杂案件符合情形，经省级检察院批准可再延两个月；可能判十年以上，依规定延长期满仍未侦查完，经省级检察院批准还能再延两个月。
3.若发现不应追责，应立即释放并发证明。

结论：
检察院批捕后羁押三月期满，处理方式多样，可能移送审查起诉、退回补充侦查、延长侦查期限或立即释放。
法律解析：
依据法律规定，当羁押三月期满且侦查终结时，公安机关会将案件移送检察院审查起诉。检察院若认为犯罪事实清楚、证据确实充分，就会向法院提起公诉；若觉得证据不足，可退回公安机关补充侦查，且补充侦查以二次为限，每次一个月。对于复杂案件，侦查期限可依法延长，如经上一级检察院批准可延长一个月，重大复杂案件符合特定情形经省级检察院批准或决定可再延长，对可能判处十年有期徒刑以上刑罚的，还能再次延长。要是发现不应追究刑事责任，需立即释放并发放释放证明。如果在实际中遇到关于检察院批捕后羁押期限及处理方式的相关法律问题，建议向专业法律人士咨询，以获取准确的法律建议和帮助。

检察院批捕后羁押三月期满有多种处理方式。若侦查终结，案件会移送检察院审查起诉，证据充分则提起公诉，证据不足可退回补充侦查。若侦查未终结，因案件复杂可申请延长侦查期限，视案件性质和严重程度，经不同层级检察院批准可延长不同时长。若发现不应追究刑事责任，则应立即释放并发放证明。

解决措施和建议如下：
1.公安机关应加快侦查进度，确保在规定期限内完成侦查工作，提高办案效率。
2.检察院要严格审查证据，准确判断是否提起公诉或退回补充侦查，保证司法公正。
3.对于需延长侦查期限的案件，要严格按照法律规定的条件和程序进行审批，避免超期羁押。
4.一旦发现不应追究刑事责任，应及时释放当事人，保障其合法权益。