当三人指认时，不承认犯罪是否会定罪

（一）对于司法机关来说，不能仅依据三人指认就定犯罪嫌疑人的罪，应全面收集各类证据，包括物证、书证、视听资料等，进行深入调查研究。
（二）要严格按照法定程序对证据进行查证，保证证据的真实性和合法性。
（三）综合全案证据进行分析，判断是否能排除合理怀疑，只有达到证据确实、充分的标准，才能认定犯罪嫌疑人有罪。

法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条规定，对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。