员工侵占公司财产100万如何判罚

（一）公司发现员工侵占财产100万，应立即收集相关证据，如财务账目、交易记录、员工操作凭证等，为后续处理提供依据。
（二）可以先与员工沟通，要求其退还侵占财产。若员工积极配合退还，可根据情况决定是否继续追究其法律责任。
（三）若员工拒不退还，公司应及时向公安机关报案，通过法律途径维护自身权益。
（四）在司法程序中，公司可根据员工的表现，如是否积极退赔、坦白罪行等，决定是否对其谅解，这可能影响最终量刑。

法律依据：
《中华人民共和国刑法》第二百七十一条第一款规定，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。