执行法官2013年4月查询被执行人公司银行流水，我并不知情。我现在查阅卷宗发现银行流水中股东与公司财产有几十笔资金往来，财产混同，但如果依据查询银行流水日期，至今已超过3年诉讼时效，是以此为证据起诉股东好，还是申请调查令让律师重新查询公司银行流水作为证据起诉股东好

针对您的情况，建议优先申请调查令让律师重新查询公司银行流水。因为2013年的流水本身已超过3年诉讼时效，直接以此起诉股东，对方可能提出时效抗辩导致败诉。而重新查询近期的流水，能证明财产混同状态持续至今，时效问题就不存在了。您需要尽快委托律师向法院申请调查令，调取被执行人公司近几年的银行流水，重点看股东与公司之间是否有频繁、无正当理由的资金往来。拿到新证据后，再以股东财产混同为由起诉要求承担连带责任。我是杭州的吴亮律师，如果仍有疑问，欢迎追问或一对一咨询。