你好，我们公司与另一家合同公司发生经济方面的纠纷，现在已经在法院打官司，请问擅自转让工程债权这种情况应如何处理？

1、已经法院生效判决确定的债权，仍属于受法律保护的债权，可以依法转让。但债权受让人无权对已经生效的法院判决申请再审。
　　
2、转让债权后，债权人应当将债权转让的情况通知债务人，未通知债务人的，该转让对债务人不发生法律效力。
　　《合同法》
　　第七十九条　债权人可以将合同的权利全部或者部分转让给第三人，但有下列情形之一的除外：
　　
（一）根据合同性质不得转让；
　　
（二）按照当事人约定不得转让；
　　
（三）依照法律规定不得转让。
　　第八十条　债权人转让权利的，应当通知债务人。未经通知，该转让对债务人不发生效力。
　　债权人转让权利的通知不得撤销，但经受让人同意的除外。
　　《最高法院关于民事诉讼法的解释》
　　第三百七十五条 当事人死亡或者终止的，其权利义务承继者可以根据民事诉讼法第一百九十九条、第二百零一条的规定申请再审。
　　判决、调解书生效后，当事人将判决、调解书确认的债权转让，债权受让人对该判决、调解书不服申请再审的，人民法院不予受理。
这些就是擅自转让工程债权这种情况应如何处理问题的回答，希望您一切顺利。