软件侵权起纠纷，解决办法多样。可先由双方当事人自行协商，达成和解协议；若协商不成，可请求著作权行政管理部门调解；也能根据书面仲裁协议或著作权合同中的仲裁条款，向仲裁机构申请仲裁；还可直接向人民法院提起民事诉讼。

软件合同违约责任包括继续履行，即违约方应按合同约定继续完成软件相关义务；采取补救措施，如对软件存在的问题进行修复完善；赔偿损失，违约方需赔偿对方因违约遭受的损失；支付违约金，依合同约定向对方支付一定数额金钱；定金罚则，收受定金方违约双倍返还，支付方违约无权要求返还。

软件著作权不算在专利范围内。软件著作权和专利是两种不同的知识产权保护形式。软件著作权保护的是软件的表达形式，即代码及相关文档；而专利保护的是软件中具有创新性的技术方案。二者在保护对象、保护条件、保护期限等方面均存在差异。

一般情况下，申请软件著作权获证周期在30-40工作日左右，但也有并行申请、加急申请的情况。并行申请能较快拿到受理通知书，而加急申请在资料符合要求且缴纳费用后，最快1个工作日可获证，不过费用相对较高。

软件注册配送日期早于协议，可能使协议签订前的软件使用缺乏明确法律约束。若出现纠纷，需结合具体情况判断协议是否具有溯及力，同时可依据相关交易记录、沟通信息等确定双方权利义务，以保障自身合法权益。