高三下学期不在学校学，不交学费，毕业证会被扣留吗

不用交学费的。学校保留学籍，等重新上学时再交学费。休学是指因病或事或其它原因暂时停止上学，学籍还保存在该学校。休学期满后返校继续学习。办理时间：学校正常开学期间承办部门：教务处教务管理办公室办理程序：学生要求休学，必须由本人书面申请（提供相应的证明材料等），所在学院提出意见，报教务处审批。
1.学生由于生病原因，经校医院提出病情诊断意见和休学建议，由学生向所学院提出书面申请并填写休学申请表
2.院(系)领导审批后，报送教务处教务管理办公室
3. 教务处教务管理办公室审核后对符合休学条件者，开出离校通知单
4. 学生凭离校通知单办理离校手续
5. 学生凭已全部周转完的离校通知单到院教学办领取休学证明回家休养

你好，严重违法校纪校规的，教育机构有权取消毕业资格。