你好！我想咨询一下铁路工程部规范导致雨天涵洞被水淹，小学生上学不能安全通过到学校障碍，政府部门不管，我们农民应当如何处理。

1.因为是修建铁路工程，涉及到的范围比较广，影响比较大，工程应该合理施工，避免对周围居民造成影响。
2.如果铁路修建不规范，对居民正常生活造成影响的，应该及时采取措施进行修复、补救，造成损失的，应该有施工负责单位承担赔偿责任。
3.但是工程建设是需要经过相关部门审批并检查核验的，通过之后才能施工。如果行政相对人对于行政部门的行政行为认为有不适当的地方，可以申请行政复议或提起行政诉讼。
4.如果行政部门有的，可以向其所属政府或上级主管部门申请行政复议或持证据直接提起行政诉讼。
5.因此，你们可以向上级主管部门或政府反映情况，可以有公民集体搜集证据并进行维权，也可以跟校方反映情况，由学校出面进行反映。