违章建筑，已经超过了二年没有发现和处理的，即不能再按违章建筑进行处理。
如果现在要拆除，应得到一定的补偿。
法律链接：《国有土地上房屋征收与拆迁补偿条例》第十九条 对被征收房屋价值的补偿，不得低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。被征收房屋的价值，由具有相应资质的房地产价格评估机构按照房屋征收评估办法评估确定。
对评估确定的被征收房屋价值有异议的，可以向房地产价格评估机构申请复核评估。对复核结果有异议的，可以向房地产价格评估专家委员会申请鉴定。
房屋征收评估办法由住房城乡建设主管部门制定，制定过程中，应当向社会公开征求意见
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