对于商标转让合同纠纷应该怎么样处理这个问题,解答如下, 转让专利申请权或专利权的合同属于技术转让合同,主要受技术合同法及其实施条例调整,并应遵守专利法的有关规定。由于审理此类合同纠纷往往涉及专利法的有关规定,因此,最高人民把此类合同纠纷作为专利纠纷案件,规定了指定管辖,而一般的专利实施许可合同纠纷案件,基层人民则可以受理。应当指出的是,解决转让专利申请权或专利权的合同纠纷,仍然按照技术合同法的规定,采用或裁或审的原则,若当事人在技术合同中约定仲裁条款的或者达成书面仲裁协议的,应当向仲裁机构申请仲裁,不得向人民。