我最近申请了一项软件专利，我以为可以保护的很好，但是我的软件专利还是被侵权了，我想问问，软件专利侵权我该怎么办？

首先要了解专利人的权利：专利权人有权决定谁可以或不可以实施其发明创造，专利权人亦可以通过订立协议的办法将他的专利技术许可给别人实施，专利权人也可以将其专利权卖给别人，买下该专利权的人就成了新的专利权人。但一旦该专利保护期满，该发明创造就可以被任何人以生产经营目的实施，原专利权人不再享有独占权。如果专利权人的权利被别人侵犯了，他有两种途径来保护自己的权益：（1）向管理专利工作的行政部门（如侵权人或侵权行为在天津的，可向天津市知识产权局）提请调处；（2）向法院提起诉讼。 基本上这些就是应对软件专利侵权的方法，希望对你有帮助。

出现软件专利侵权后，一般有三种解决途径。但是不管选择其中一种或几种途径，首先要做的工作就是收集专利侵权的证据。只有做好了这一步的工作，后面的措施才有了主动权，否则，后面的工作无法开展。解决专利侵权时应当收集的证据包括：　　
1、专利权属证据。证明原告享有专利权或者专利许可使用权。　　
2、侵权存在证据。证明被告已经实施或者即将实施侵犯专利权的行为。原告应当提交被控侵权产品及其销售发.票、专利与被控侵权产品技术特征对比材料等证据。　　
3、赔偿金额证据。证明其提出的赔偿金额有事实依据。原告应当提交能证明其提出的赔偿数额的证据，如权利人因被侵权所受到的损失的证据或者侵权人因侵权所获得的利益的证据;权利人因被侵权所受到的损失或者侵权人因侵权所获得的利益难以确定的，人民法院可以参照专利许可使用费的倍数合理确定赔偿数额;没有专利许可使用费可以参照或者专利许可使用费明显不合理的，人民法院可以根据专利权的类别、侵权行为的性质和情节等因素，确定赔偿数额。上述赔偿数额可以包括因调查、制止侵权行为所支付的合理费用。   证据收集好之后，可以根据自己的情形选择如下侵权解决方式：　　
1、协商与和解：专利权人和被控侵权人均可自行协商或在其他第三方的调解、斡旋下达成和解协议，解决纠纷。提出协商意向时一般可以向侵权方发送侵权警告函。这在我国专利法中并无规定，但在现实生活中却被经常使用，而且还常取到较好的作用。侵权警告信的写法可以根据不同情况，口气可以强硬，也可以缓和。一般应写明以下内容：   (1)专利权人的专利号，专利的主要权项内容;(2)对方的产品或方法侵害了该专利权，希望中止或禁止对方制造、销售和使用的行为; (3)希望对方于何时就此作出答复;(4)如果对方不作答复，专利权人可能采取的措施。　　
2、行政裁决或协调专利权人在侵权人侵权事实和证据充分确凿的情况下，可向专利局等有关行政部门举报，由其采取行政措施，对侵权人的侵权行为进行调查核实后作出行政处罚。在行政裁决过程中，有关专利行政部门基于有关当事人的申请，可对专利侵权的民事责任进行调解。　　
3、向法院起诉：专利权人在发现侵权人侵犯其专利权后，亦可径自向侵权行为地、被告所在地等相关人民法院提起民事诉讼，要求停止侵权行为赔偿经济损失等。同时有权申请对侵权人的侵权事实和证据进行诉讼保全，申请法院强制令，禁止侵权人继续侵权行为。为保证经济赔偿的切实执行，专利权人在起诉的同时，可向受理法院申请对侵权人的等额财产进行诉讼保全。   向法院提起诉讼时，选择起诉的法院可以有：　　(1)专利侵权纠纷案件，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。侵权行为地包括：  
a.被控侵犯发明、实用新型专利权的产品的制造、使用、许诺销售、销售、进口等行为的实施地  
b.专利方法使用行为的实施地，依照该专利方法直接获得的产品的使用、许诺销售、销售、进口等行为的实施地;
c.外观设计专利产品的制造、销售、进口等行为的实施地;
d.假冒他人专利的行为实施地;  
e.上述侵权行为的侵权结果发生地。　　(2)原告仅对侵权产品制造者提起诉讼，未起诉销售者，侵权产品制造地与销售地不一致的，制造地人民法院有管辖权;以制造者与销售者为共同被告起诉的，销售地人民法院有管辖权;销售者是制造者的分支机构，原告在销售地起诉侵权产品制造者制造、销售行为的，销售地人民法院有管辖权。　　(3)专利权属纠纷案件，由被告住所地人民法院管辖。　　(4)专利权合同纠纷案件，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。合同当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。　　做上述工作如果自己没有经验或能力，建议最好委托律师等专业人员代为处理，否则，也容易处于被动。因为处理专利侵权毕竟是专业性和程序性很强的。