在医疗期间的患病员工协商解除劳动合同不违法怎么处理

　　《劳动合同法》第42条规定：患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的，单位不能单方面解除劳动合同。您的法定医疗期是24个月，在此期间，单位不能单方面解除劳动合同，但是您与单位是协商解除劳动合同，您放弃了自己的权利，因此这份解除劳动关系的合同是真实有效的。　　最高人民法院《关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释（三）》第10条规定：“劳动者与用人单位就解除或者终止劳动合同办理相关手续、支付工资报酬、加班费、经济补偿或者赔偿金等达成的协议，不违反法律、行政法规的强制性规定，且不存在欺诈、胁迫或者乘人之危情形的，应当认定有效。前款协议存在重大误解或者显失公平情形，当事人请求撤销的，人民法院应予支持。”因此，您与单位协商后达成的经济补偿协议只要不“存在重大误解或者显失公平情形”，就应该被认定为是有效的，您的要求不会得到法律的支持。