医疗纠纷处理程序因选择的途径不同而不同,如选择申请卫生行政部门处理,则程序如下:1、以书面形式申请卫生行政部门处理;2、卫生行政部门收到申请十日内进行审查,决定是否受理;3、如受理,必要时可以进行医疗技术鉴定;4、依据鉴定结果,作出行政处理决定,进行赔偿调解。《医疗事故处理条例》第三十七条规定,发生医疗事故争议,当事人申请卫生行政部门处理的,应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内,可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。 法律依据《医疗事故处理条例》第三十七条发生医疗事故争议,当事人申请卫生行政部门处理的,应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内,可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。