刑事诉讼中协议管辖如何确定

由人民法院直接受理。当事人如提起刑事自诉案件，一般由犯罪地的人民法院行使管辖权。刑事自诉案件的自诉人、被告人一方或者双方是港、澳、台居住的中国公民或者单位的，由犯罪地的基层人民法院审判。
人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判;缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。
对于被害人有证据证明的轻微刑事案件(如轻伤、重婚、遗弃等)，被害人无证据或者证据不充分的，人民法院应当说服其撤诉或者裁定驳回起诉。必要时，也可以将案件移送公安机关处理。