重庆户籍归哪个部门管理

1、户籍管理归属公安系统，公安系统的户籍科负责专门管理。
2、作为公安局的派出机构，乡镇派出所也承担户籍管理的职责。
法律依据：《户口登记条例》第三条户口登记工作，由各级公安机关主管。城市和设有公安派出所的镇，以公安派出所管辖区为户口管辖区;乡和不设公安派出所的镇，以乡、镇管辖区为户口管辖区。乡、镇人民委员会和公安派出所为户口登记机关。