执行死刑时发现罪犯有重大立功怎么办

结论：执行死刑时发现罪犯有重大立功的，应当停止执行，并且立即报告最高人民法院，由最高人民法院作出裁定。
解析：
执行死刑时发现罪犯有重大立功的，应当停止执行，并且立即报告最高人民法院，由最高人民法院作出裁定。《刑事诉讼法》第二百六十二条规定，在执行前罪犯揭发重大犯罪事实或者有其他重大立功表现，可能需要改判的，应当停止执行，并且立即报告最高人民法院，由最高人民法院作出裁定。
法律依据：
《刑事诉讼法》第二百六十二条
下级人民法院接到最高人民法院执行死刑的命令后，应当在七日以内交付执行。但是发现有下列情形之一的，应当停止执行，并且立即报告最高人民法院，由最高人民法院作出裁定：
（一）在执行前发现判决可能有错误的；
（二）在执行前罪犯揭发重大犯罪事实或者有其他重大立功表现，可能需要改判的；
（三）罪犯正在怀孕。
前款第一项、第二项停止执行的原因消失后，必须报请最高人民法院院长再签发执行死刑的命令才能执行；由于前款第三项原因停止执行的，应当报请最高人民法院依法改判。