传染病菌种扩散罪处罚会怎么样规定的

结论：两种情形。
解析：
传染病菌种扩散罪量刑标准有两种情形：
1、犯此罪，如果后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役;
2、犯此罪，如果后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
传染病菌种、毒种扩散罪的主体是从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员。
法律依据：
《刑法》第三百三十一条
从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役;后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。