你好，我住院的时候已经用了医保，但是医生在我不知情的情况下使用了自费项目，

这种情况你可以采取以下措施：

1. 与医生沟通：首先找医生询问清楚为什么使用自费项目，是否有必要以及是否存在误解等情况。

2. 向医院医保部门反映：说明情况，要求对自费项目的使用进行解释和说明，看是否符合相关规定和程序。

3. 查看医院规定：了解医院对于自费项目使用的内部管理规定，看是否存在违规操作。

4. 考虑投诉：如果认为医院的处理不满意或存在不合理之处，可以向医院的投诉管理部门或上级卫生行政部门投诉。

5. 保留相关证据：包括病历、费用清单等，以便后续可能的交涉或维权使用。

一般来说，医院在使用自费项目时应该提前告知患者或取得患者同意，以保障患者的知情权和选择权。