非法占用农用地罪的立案标准是这样的:首先,如果非法占用基本农田达到五亩以上,或者基本农田以外的耕地达到十亩以上,那就符合立案条件。其次,要是非法占用防护林地或者特种用途林地,单种或者加起来一共五亩以上,也能立案。再者,非法占用其他林地十亩以上同样可以。还有,如果非法占用防护林地、特种用途林地或者其他林地,其中一项达到相应规定数量标准的百分之五十以上,并且两项加起来达到规定数量标准,也得立案。另外,非法占用草原二十亩以上,或者之前因为非法占用草原受过行政处罚,三年内又非法占用草原且改变用途,数量在十亩以上,也满足立案要求。只要达到这些标准中的一个,就得立案追诉。这个罪说的是违反土地管理法规,非法把农用地改作别的用途,数量大还造成农用地大量毁坏的行为。