被强奸人失踪法院会怎么判决

（一）若要使案件能顺利审理判决，应尽量收集多种证据。可以围绕犯罪现场寻找监控画面，查看是否有记录犯罪过程的画面；寻找现场的证人，获取他们的证言；对现场遗留的生物样本进行鉴定，以作为证实犯罪的有力证据。

（二）司法机关应积极寻找失踪的被害人。通过发布寻人启事、走访被害人可能出现的地方等方式，争取让被害人尽快出现，完善证据收集。

（三）如果证据不足，法院要遵循疑罪从无原则作出无罪判决。相关部门不能因急于结案而违背法律规定。

法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条规定，对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。