协议离婚但是结婚证不在怎么办

结论：
协议离婚时结婚证不在，一方结婚证丢失可凭另一方结婚证办离婚；双方结婚证丢失需先补领，再携带相关材料申请离婚登记并经过冷静期领证。
法律解析：
依据相关法律规定，婚姻登记机关在处理离婚登记时有明确流程。当只有一方结婚证丢失，以另一方结婚证为依据办理离婚是合理可行的操作。而双方结婚证都丢失的情况下，先向原办理婚姻登记机关或一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领，登记机关查证档案属实后补发，这是为了确保婚姻关系的真实性和合法性。补领后按正常流程，夫妻带齐身份证、户口本、补领的结婚证及离婚协议书等材料申请离婚登记，经过冷静期后才可申请发给离婚证。如果在协议离婚过程中遇到结婚证相关问题或其他法律疑问，可向专业法律人士咨询，以保障离婚程序合法顺利进行。

1.协议离婚时结婚证不在，可按不同情况处理。若仅一方结婚证丢失，婚姻登记机关能依据另一方的结婚证办理离婚登记。若双方结婚证都丢失，需先补领结婚证。
2.解决措施和建议：
-双方结婚证丢失时，当事人应前往原办理婚姻登记的机关或一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领。婚姻登记机关会查证婚姻登记档案，确认属实后补发。
-补领结婚证后，夫妻双方准备好身份证、户口本、补领的结婚证及离婚协议书等材料，共同到婚姻登记机关申请离婚登记。
-申请离婚登记后，要经过冷静期，之后再申请发给离婚证。

法律分析：
（1）当只有一方结婚证丢失时，婚姻登记机关依据另一方的结婚证办理离婚登记，这是为了便利夫妻双方在特殊情况下仍能顺利进行协议离婚流程，保障其离婚权利。
（2）若双方结婚证都丢失，需先补领结婚证。当事人可向原办理婚姻登记的机关或一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请，婚姻登记机关会查证档案，确认属实后补发。这一程序是为了确保婚姻关系的真实性和合法性。
（3）补领结婚证后，夫妻双方携带身份证、户口本、补领的结婚证及离婚协议书等材料，共同到婚姻登记机关申请离婚登记，经过冷静期后再申请发给离婚证，这符合协议离婚的法定程序。

提醒：
办理过程中要确保所提供材料真实有效，不同地区婚姻登记机关的具体要求可能有差异，建议提前咨询。

（一）一方结婚证丢失：婚姻登记机关可依据另一方的结婚证办理离婚登记。

（二）双方结婚证丢失：先向原办理婚姻登记的机关或一方常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领结婚证，婚姻登记机关查证婚姻登记档案确认属实后补发。补领后，夫妻双方带身份证、户口本、补领的结婚证及离婚协议书等材料，共同到婚姻登记机关申请离婚登记，经过冷静期后，再申请发给离婚证。

法律依据：
《婚姻登记条例》第十七条规定，结婚证、离婚证遗失或者损毁的，当事人可以持户口簿、身份证向原办理婚姻登记的机关或者一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领。婚姻登记机关对当事人的婚姻登记档案进行查证，确认属实的，应当为当事人补发结婚证、离婚证。