夫妻分居女方怀孕了究竟该怎么办

结论：
夫妻分居期间女方怀孕，孩子是丈夫的，双方可协商生育、抚养等事宜，也可协议或诉讼离婚；孩子非丈夫的，丈夫离婚时可要求损害赔偿，女方构成犯罪要担责，双方可先沟通，协商不成可走法律途径。
法律解析：
《民法典》规定，夫妻有互相忠实的义务。当孩子是丈夫的，夫妻双方对是否生育、孩子抚养等问题可自由协商。若要离婚，协议离婚需签订离婚协议，经离婚冷静期后办理手续；诉讼离婚则由一方向法院提起。若孩子非丈夫的，女方违背了夫妻忠实义务，丈夫在离婚诉讼中有权要求女方给予损害赔偿。若女方行为构成重婚等犯罪，要依法承担刑事责任。遇到此类复杂的婚姻问题，每个人的情况不同，法律处理方式也有差异。若在处理过程中遇到难题，可向专业法律人士咨询，以获得更精准的法律建议和解决方案。