当法院解除合作协议会带来什么后果

（一）合同层面，当事人要停止未履行的部分，已经履行的部分，可要求恢复原状、采取其他补救措施或赔偿损失。例如货物买卖中，未交付的货物不用再交付，已交付的货物可要求退回。
（二）财产方面，占有对方财产的要返还，不能返还或没必要返还的折价补偿。有过错方赔偿对方损失，双方都有过错则各自担责。比如合作开店，一方多占资金需返还。
（三）涉及知识产权成果，要明确归属和后续使用。如合作研发的软件，需确定谁能继续使用。
（四）处理好与第三方的关系，避免新纠纷。比如合作对外签了服务合同，要和第三方协商后续事宜。

法律依据：
《中华人民共和国民法典》第五百六十六条规定，合同解除后，尚未履行的，终止履行；已经履行的，根据履行情况和合同性质，当事人可以请求恢复原状或者采取其他补救措施，并有权请求赔偿损失。合同因违约解除的，解除权人可以请求违约方承担违约责任，但是当事人另有约定的除外。主合同解除后，担保人对债务人应当承担的民事责任仍应当承担担保责任，但是担保合同另有约定的除外。