乡村道路改造工程抬高路面导致我家院里的雨水不能正常流出道治房屋整齐变形无法居住了

先说结论：乡村道路改造抬高路面，导致你家院落雨水排不出去、房屋受损，施工或管理方有过错的，应当承担修复和赔偿责任。

这种情况属于因公共工程施工改变排水走向、造成相邻不动产损害的侵权。你可先找施工单位、村委会和乡镇政府反映，要求恢复排水或做引流措施，并委托第三方对房屋变形原因做鉴定，固定「路面抬高—雨水倒灌—墙体开裂」的因果关系证据。

协商不成，可向法院起诉施工方及发包方，要求排除妨害、修复排水并赔偿房屋修缮费用。注意及时拍照录像、保留报修记录，不要自行拆除以免破坏证据。
再补充一点：这类因公共工程导致的相邻损害，往往不止你一户受影响，可以联合邻居共同反映、共同举证，分量更重。损失较大的，先别自行大修，等鉴定明确原因和责任后再动工，便于索赔。