检察院自侦案件不起诉该怎么处理

在检察院自侦案件作出不起诉决定后，有一系列的处理办法。要是被不起诉人还在关押中，那得马上放人。而且之前侦查时查封、扣押、冻结的财物，也得赶紧解除相关措施，把东西归还给人家。
要是被不起诉人在侦查期间人身自由受限，或者财产有损失，他们有权利去申请国家赔偿，这是法律给他们保障自身权益的途径。
要是案件是公安机关移送过来的，公安机关觉得不起诉决定不对，能要求检察院重新讨论，要是检察院没接受他们的意见，还能向上一级检察院申请再次审核。
被害人要是对这个不起诉决定不满意，在收到决定书七天内，可以找上一级检察院申诉，让他们重新提起公诉。上一级检察院复查后会给出结果，通知被不起诉人，也会告知公安机关。要是上一级检察院维持原来的不起诉决定，被害人也能去法院起诉。而且被害人也可以不经过申诉这一步，直接到法院去起诉。
如果自侦案件里有工作人员违法违纪，检察机关会按照规定给他们纪律处分，严重的还要追究法律责任。同时，检察院要把不起诉决定书送到相关单位和个人手上，并且清楚说明为啥不起诉，依据的是哪条法律，让大家都能明白。
建议相关人员遭遇这些情况时，及时咨询律师，了解自身权利和可行的法律途径，确保自身合法权益。