首先,合同可以约定违约金。但是根据《合同法》滴一百一十四条规定,当事人可以约定违约金,也可以约定违约金产生的方法。但是,约定的违约金“过分”高于造成的损失的,当事人可以请求人民法院或者仲裁机构适当减少。但是记住,法律的要求是“过分”高于损失。
其次,对于科研项目,你们应当详细约定科研的交付成果标准,以及科研失败后委托方和受托方对损失的分担问题。
再次,合同责任为严格责任,除非为不可抗力或者意外事件意外,当事人不得找任何借口拒绝履行生效的合同。
具体到本案中,对于委托技术开发合同的特殊性,我认为:
1、你们要约定详细的成果标准。既然是实验,可否列明实验的次数、时间等等能够量化的标准。是否可以约定第三方鉴定来认可标准。
2、约定的违约金以不超过受托方利润为限。
3、作为受托方,你们应当分开、详细列明对于本次委托科研的开支成本情况。