您好，我叔叔前几天出门的时候代表公司去签订一份合同，我叔叔签订了合同了之后，对方现在不承认和我叔叔签订合同，申请了笔迹鉴定由不认可方申请，谁举证

由被告对抗辩事实进行举证，这是对“谁主张、谁举证”原则的正确理解。
二、笔迹鉴定的分类有哪些
1943年，犯罪学家徐圣熙，将笔迹特征分为八种：
(1)字行的趋向;
(2)字迹倾斜的角度;
(3)字体的大小;
(4)字体的不同样式;
(5)整齐或杂乱;
(6)连续或间断;
(7)笔画的轻重;
(8)运笔的快慢。
1949年以后，笔迹的分类较多，其中比较有代表性的主要有：1958年中国笔迹鉴定专家的分类，将笔迹特征分为一般特征和个别特征两个方面。笔迹的一般特征是指笔迹的熟练程度、大小、间隔、倾斜度、连贯性、均匀程度、字型和压力的大小等;笔迹的个别特征包括十个方面。主要有运笔、搭配比例、笔顺、字的写法、标点符号的写法等。另一个有代表性的分类是1999年，贾玉文教授将笔迹特征分为九大类：
(1)概貌特征;
(2)局部安排特征;
(3)写法特征;
(4)错别字特征;
(5)搭配比例特征;
(6)笔顺特征;
(7)运笔特征;
(8)笔痕特征;
(9)书面语言特征极其应用等。