民事诉讼法第三十三条规定：“因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。”新民诉法解释第二十八条第三款在此基础上予以明确规定：“不动产已登记的，以不动产登记簿记载的所在地为不动产所在地;不动产未登记的，以不动产实际所在地为不动产所在地。”该规定明确了建设工程施工合同纠纷适用专属管辖，明确以不动产所在地即建设工程所在地法院为管辖法院，大大减少了因管辖权而发生的争议，也符合民事诉讼的“两便原则”，即便于人民法院审理和便于人民群众诉讼。
另外，根据民事诉讼法规定，因不动产纠纷提起的诉讼适用专属管辖，当事人在约定管辖法院、提起管辖权异议的时候都不能违反级别管辖和专属管辖的有关规定。
因此，建设工程施工合同纠纷当事人，只能约定由不动产所在地即建设工程所在地法院管辖案件，不能约定其他法院管辖。
法律依据：《民事诉讼法》
第二十三条 合同纠纷管辖
因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
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