起诉事业单位是民事诉讼还是行政诉讼那要看起诉的内容是什么。
民事诉讼是调整平等主体之间的人身财产关系,行政诉讼是调整不平等主体间的纠纷。不能一概以被告的身份作为民事与行政诉讼的区分标准。
如你与公安机关签订了办公用品买卖合同,履行合同时产生纠纷,那你们之间的合同纠纷属于民事纠纷,因为你与公安机关是平等的,公安机关并未依职权对你进行管理。你提问中提及的是事业单位,一般不能与你产生行政关系,除非是国家法律对其授权或其他行政机关委托该事业单位履行部分行政管理职能,在这种情况下有可能产生行政诉讼,否则有可能是民事诉讼关系。