员工患重大疾病住院治疗期间，公司辞退员工合法吗

要看解除劳动合同原因。　　根据《劳动合同法》规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的，用人单位不得解除劳动合同，但劳动者具有《劳动合同法》
第三十九条情形的除外。　　附《劳动合同法》
第三十九条　劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：　　
(一)在试用期间被证明不符合录用条件的;　　
(二)严重违反用人单位的规章制度的;　　
(三)严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的;　　
(四)劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的;　　
(五)因本法
第二十六条
第一款
第一项规定的情形致使劳动合同无效的;　　
(六)被依法追究刑事责任的。