舅妈朋友的工厂因为被举报存在一些不合理生产的原因，他朋友申请了法院的处理，接受调差，结果还是被查出了，会关闭工厂一段时间，我国规定的行政强制只能由人民法院强制执行吗？

不一定。
1、申请的行政机关自身没有强制执行权。
根据行政强制执行权法定原则，行政机关的行政强制执行权只能由法律规定。行政强制法实施前已经设定了行政强制执行的行政法规，在行政强制法实施后必须加以修正，如不修正的，自2012年1月1日起，有关行政强制执行的条款自动失去法律效力。同时也应当注意，一旦法律授予了行政机关强制执行权，该行政机关就不能主动放弃强制执行权转而申请人民法院强制执行。
2、行政决定的相对人在法定期限内没有申请复议或者提起诉讼。
《行政强制法》第五十三条规定“当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不履行行政决定的，没有行政强制执行权的行政机关可以自期限届满之日起三个月内，申请人民法院强制执行”。在法律规定的行政复议和行政诉讼期限届满后，人民法院方可受理、审查并执行，在行政复议和行政诉讼期限未满时，人民法院不得强制执行，在行政复议或者行政诉讼过程中人民法院更不能强制执行。
3、行政决定确定的义务人没有履行行政决定。
没有履行是指没有完全履行，包括了全部没有履行，也包括只履行了行政决定的部分义务。
4、申请人民法院强制执行的期限只有3个月。
《行政强制法》规定的行政机关申请人民法院强制执行的期限3个月，其性质属于除斥期间，没有中止、中断或者延长的说法，在此期间之外的人民法院不予受理。《行政强制法》第五十四条规定“行政机关申请人民法院强制执行前，应当催告当事人履行义务。催告书送达十日后当事人仍未履行义务的，行政机关可以向所在地有管辖权的人民法院申请强制执行;执行对象是不动产的，向不动产所在地有管辖权的人民法院申请强制执行”。