货物运输业增值税专用发票可抵扣多少进项税额

1、货物运输业增值税专用发票可抵扣11%的进项税额。
2、相关规定：
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1）财税【2011】111号附件1.《交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点实施办法》第十二条提供交通运输业服务，税率为11%。第二十二条下列进项税额准予从销项税额中抵扣...（一）从销售方或者提供方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。所以只要您单位用于应增值税应税项目的，取得的税率为11%的货物运输业增值税专用发票其进项税额可以抵扣。
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2）国税函【2009】617号规定：增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。所以增值税专用发票是当月认证当月抵扣的，您的运输专用发票当月认证当月没有抵扣，按规定是不能再抵扣了。