修订后的《办法》(环境保护部令第8号)由原来的5章53条增加到8章82条，得到了充实和细化。
第一章是总则，
第二章是实施主体与管辖，
第三章和
第四章是行政处罚的程序，
第五章是执行，
第六章是结案和归档，
第七章是监督，
第八章是附则。修订后的《办法》在立法目的、制度设计、执法形式和监督形式上都有一些突破。修订后的《办法》突出了以人为本，坚持保障环保部门依法行使职权与保护当事人合法权益相结合；在制度设计上，突出环保特色，强调各部门之间的协作配合，形成执法合力；在执法形式上，兼顾了处罚违法与纠正违法，强调执法效果；在监督形式上，实行内外结合，形成全方位的监督网络。
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