1、两者对应的群体不同经适房提供给城市低收入的城镇居民;农民安置房提供给土地被征占的农村住民。
2、两者申请方式不同经适房面对该城市所有符合条件的居民,只要符合条件,全市范围内的居民都可以申请;农民安置房一般都是一对一提供,于占地无关的农村住民不能申请安置房。
3、两者权属不同经适房属于商品房的一种,以优惠的价格提供给申请人。满足一定条件下,经适房可以转化为商品房,进入房屋市场流通。农村安置房属于集体土地建房,按照国家相关政策,仅能在本村镇农村内部进行买卖,不能上市流通。
4、两者管理机构、建设机构不同经适房由政府统一规划,建设主管部门安排建设,属于政府工程;农村安置房由乡、村委会自行规划建设。